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 上海市水利工程協會于2013年1月18日召開成立大會，是上海市水利工程建設與管理等企、事業單位及其它相關組織和個人自愿結成的專業性、非營利性、全市性的行業自律組織。登記管理為上海市民政局，業務主管為上海市水務局。

      協會宗旨是團結廣大會員遵守憲法、法律、法規，貫徹執行國家和地方有關方針政策；遵守社會道德風尚，促進社會主義物質文明與精神文明建設；發揮聯系政府與會員之間的橋梁與紐帶作用，維護會員合法權益，反映會員訴求；繁榮水利，服務大局，助力上海經濟社會高質量發展。

      協會理事會常設辦事機構為秘書處，負責協會日常工作開展。秘書處內部機構有綜合辦公室（財務部）、教育培訓部、業務工作部。同時，成立了水利工程施工、水土保持、河湖養護、教育培訓、材料設備、工程咨詢、水閘運維等7個專業委員會、1個教育基地、1個水利職業技能等級認定中心。

 
      協會會員分為單位會員和個人會員。凡承認本會章程，自愿加入并積極支持和參與協會活動、在上海市內從事水利工程項目管理、勘察、設計、咨詢、監理、施工、檢測、運行、維修、養護、物資生產和供應等業務的企、事業單位及其它相關組織和個人，均可申請成為單位會員和個人會員。目前，協會已有單位會員572家，個人會員24人。
 
上海市水利工程協會于2021年11月26日召開了第三次會員代表大會暨第三屆理事會第一次會議，選舉產生了協會第三屆領導機構。協會是4A級社會組織，為上海市水務局“文明單位”、上海市水務海洋系統“治水管海先鋒”示范黨組織。